近日微軟發布了Windows HPC Server 2008 R2，並在壹份新聞稿中大膽的聲稱：”最近的研究表明，使用Windows HPC Server比使用基於Linux的HPC系統便宜32%～51%”。微軟：Windows HPC Server比Linux更便宜這個”最近的研究”是由微軟主辦的，並委托Crimson咨詢公司調查。該研究調查了壹個由250個計算節點和1000個桌面節點組成的HPC系統，統計出分別部署Windows HPC Server和兩個Linux方案的成本。
“微軟的方案確實減少了TCO，”蒙大拿州洛基山超級計算機中心的主任Earl Dodd表示，Dodd為客戶同時運行基於Linux和Windows的計算機集群，”從總體成本來說，Windows比Linux要便宜。”Dodd的客戶大多是中小企業，這些客戶采用Windows壹般無需花費培訓成本。微軟贊助的TCO研究報告說，成本節省大多來自現有基礎架構的集成，比如使用現有的Windows服務器技術管理HPC設備，省下了壹大筆培訓費用。
因此，研究結果似乎認為客戶們更需要Windows，而不是Linux。很多與微軟有關的網站都認為”Windows降低了TCO”，但都沒有給出直接的證明。微軟高調推廣HPC似乎是看到了高性能計算的廣闊前景，研究報告也表示，在過去被認為是最先進的研究人員和科學家才會使用的HPC已經逐漸成為主流，HPC現在正被廣泛的應用於商業和學術機構。
如果Windows HPC Server真的比Linux更便宜，那我們會看到Windows大量部署在超級計算機中。但情況並非如此，當在世界上規模最大最快的超級計算機上運行時，Windows還遠遠談不上超過Linux，世界超級計算機500強榜單顯示，只有5臺超級計算機使用了Windows。當然，當壹個公司運行的業務量不多，並且運行環境大都是Windows的情況下，使用HPC采用Windows方案會便宜壹些。